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Los Mejores Programas de Facturación en España: Guía Completa para Autónomos y Pymes

12 febrero, 2026
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Los Mejores Programas de Facturación en España: Guía Completa para Autónomos y Pymes
Photo: Freepik.

Elegir el software de facturación adecuado puede transformar la gestión de tu negocio. Lo que antes suponía horas de trabajo manual con hojas de cálculo y carpetas de papel ahora se resuelve con unos pocos clics.

Pero no todos los programas de facturación ofrecen el mismo valor. Algunos se limitan a crear facturas básicas. Otros integran contabilidad, gestión de gastos y cumplimiento fiscal en una sola plataforma. Con la llegada de Verifactu y las nuevas exigencias de facturación electrónica, elegir un software certificado y preparado para el futuro resulta más importante que nunca.

Los mejores programas permiten automatizar hasta 40 horas de trabajo al mes y procesar facturas significativamente más rápido. Esta es solo una de las muchas herramientas digitales que están transformando la gestión empresarial. Más de 80.000 empresas en España ya utilizan este tipo de soluciones para eliminar el caos administrativo y centrarse en hacer crecer sus negocios.

Esta guía analiza los mejores programas de facturación disponibles en España. Evaluamos funcionalidades, facilidad de uso, cumplimiento normativo y relación calidad-precio para ayudarte a tomar la mejor decisión.

Qué Buscar en un Software de Facturación

Antes de examinar las opciones específicas, conviene entender qué características distinguen a los mejores programas de facturación.

Certificación Verifactu. Según el Real Decreto-ley 15/2025, las sociedades deberán tener sus sistemas adaptados antes del 1 de enero de 2027, mientras que los autónomos tienen hasta el 1 de julio de 2027. Los fabricantes de software ya deben ofrecer soluciones compatibles desde julio de 2025. Utilizar software no homologado generará problemas de cumplimiento y posibles sanciones. Verifica que el programa cuente con el sello de software certificado.

Automatización real. Crear facturas manualmente consume tiempo valioso. Los mejores programas permiten facturas recurrentes, envío automático y recordatorios de pago sin intervención manual.

Contabilidad integrada. Separar facturación y contabilidad multiplica el trabajo. Los programas que generan asientos contables automáticamente con cada movimiento simplifican enormemente la gestión fiscal.

Conciliación bancaria. Conectar el software con tu banco para conciliar facturas con movimientos bancarios automáticamente elimina horas de trabajo manual.

Facilidad de uso. El mejor software del mundo no sirve si nadie puede utilizarlo. La interfaz debe ser intuitiva para que cualquier persona del equipo pueda manejarla sin formación extensiva.

Soporte y formación. Cuando surgen dudas, necesitas respuestas rápidas. Chat en vivo, teléfono y webinars formativos marcan la diferencia entre frustración y éxito.

Los mejores programas de facturación en España

1. Holded

Mejor para: Autónomos y pymes que buscan una solución integral de facturación, contabilidad y gestión empresarial en una sola plataforma.

Holded se ha consolidado como el software de gestión en la nube líder en España, con más de 80.000 empresas confiando en su plataforma. Su propuesta va más allá de la simple facturación: conecta facturación, contabilidad, inventario, proyectos y CRM en un solo lugar.

Los números hablan por sí solos. Los usuarios de Holded automatizan 40 horas de trabajo al mes, procesan facturas 160 veces más rápido y cobran un 80% más rápido gracias a las herramientas de gestión de cobros integradas. Estos resultados explican su calificación de «Excelente» con más de 2.200 reseñas en Trustpilot.

Facturación profesional y automatizada. Crear facturas con todos los requisitos legales lleva apenas unos clics. Más de 50 plantillas editables permiten personalizar facturas, presupuestos y comunicaciones para que reflejen la imagen profesional de tu empresa. Las facturas recurrentes se programan una vez y el sistema las genera y envía automáticamente.

Contabilidad sin complicaciones. Holded traduce lo complejo y lo hace fácil e intuitivo. Los asientos automáticos en el libro diario se generan con cada movimiento contable. Los informes en tiempo real permiten saber en todo momento en qué punto está tu negocio, transformando la contabilidad de una obligación temida a una herramienta útil para tomar decisiones.

Preparado para Verifactu. Holded cuenta con el sello de software certificado Verifactu, garantizando cumplimiento normativo sin complicaciones. Los negocios que utilizan Holded están preparados para los cambios regulatorios que ya están entrando en vigor.

Gestión integral del negocio. Más allá de la facturación, Holded ofrece gestión de inventario en tiempo real, CRM para gestionar oportunidades comerciales, gestión de proyectos y herramientas de recursos humanos para nóminas y gestión del equipo. Todo conectado en una sola plataforma.

Automatizaciones que ahorran tiempo. El escáner digitaliza y clasifica facturas de proveedores automáticamente. La conciliación bancaria conecta con tu banco de forma segura. La presentación de modelos de IVA e IRPF se rellena automáticamente y se envía telemáticamente.

Empresas reconocidas como DR Bloom, TwoJeys, Nude Project, Brava y Tascón ya confían en Holded para su gestión diaria. El soporte incluye chat en vivo, contacto telefónico (+34 930 478 967) y webinars formativos gratuitos.

Puntos fuertes: Solución integral todo en uno, certificación Verifactu, automatización de 40 horas mensuales, más de 50 plantillas personalizables, conciliación bancaria automática, excelente valoración en Trustpilot, prueba gratuita de 14 días.

Limitaciones: Algunas funcionalidades avanzadas requieren planes superiores.

Precio: Prueba gratuita de 14 días disponible. Planes desde precios accesibles con opciones escalables según las necesidades del negocio.

2. Sage

Mejor para: Empresas medianas y grandes que buscan software de gestión con amplia trayectoria en el mercado.

Sage es una de las marcas más establecidas en software empresarial a nivel mundial. Su oferta en España incluye varias soluciones adaptadas a diferentes tamaños de empresa.

El programa ofrece funcionalidades de facturación, contabilidad y gestión fiscal. Su amplia presencia en el mercado significa una red extensa de asesores y profesionales familiarizados con sus sistemas.

Las soluciones de Sage están orientadas principalmente a empresas con necesidades más complejas y equipos contables dedicados. La curva de aprendizaje puede ser más pronunciada que en alternativas más modernas.

Puntos fuertes: Marca establecida, amplia red de profesionales certificados, soluciones para diferentes tamaños de empresa.

Limitaciones: Interfaz menos intuitiva que alternativas más modernas, puede resultar complejo para autónomos y pequeñas empresas, precios generalmente más elevados.

Precio: Variable según la solución y tamaño de empresa. Generalmente en el rango medio-alto del mercado.

3. Contasol

Mejor para: Autónomos y pequeñas empresas que buscan una opción gratuita con funcionalidades básicas.

Contasol ofrece una versión gratuita de su software de facturación y contabilidad, lo que lo convierte en una opción atractiva para quienes están comenzando o tienen presupuestos muy limitados.

El programa cubre las funcionalidades básicas de facturación y contabilidad. La versión gratuita incluye limitaciones en algunas características avanzadas.

La interfaz tiene un diseño más tradicional que puede resultar menos intuitivo para usuarios acostumbrados a aplicaciones modernas. El soporte en la versión gratuita es limitado.

Puntos fuertes: Versión gratuita disponible, funcionalidades básicas cubiertas, opción económica para comenzar.

Limitaciones: Interfaz menos moderna, funcionalidades avanzadas limitadas en versión gratuita, menor integración con otras herramientas.

Precio: Versión gratuita con limitaciones. Versiones de pago para funcionalidades avanzadas.

4. Billin

Mejor para: Autónomos que buscan una solución sencilla centrada principalmente en facturación.

Billin se posiciona como una herramienta de facturación sencilla y accesible para autónomos. Su enfoque está en simplificar la creación y envío de facturas sin complicaciones.

La plataforma ofrece plantillas de facturas, gestión de clientes y seguimiento de pagos. La interfaz es limpia y fácil de usar para tareas básicas de facturación.

Las funcionalidades de contabilidad y gestión empresarial son más limitadas que en plataformas integrales. Para negocios que necesitan más que facturación básica, puede quedarse corto.

Puntos fuertes: Sencillez de uso, enfoque en facturación, interfaz limpia.

Limitaciones: Funcionalidades limitadas más allá de la facturación, menos opciones de integración, puede quedarse corto para negocios en crecimiento.

Precio: Planes desde precios accesibles. Opciones gratuitas con limitaciones.

5. Anfix

Mejor para: Autónomos y pequeñas empresas que buscan facturación y contabilidad con conexión a asesorías.

Anfix ofrece software de facturación y contabilidad con énfasis en la colaboración con asesorías fiscales. La plataforma facilita compartir información contable con asesores externos.

El programa incluye facturación, control de gastos, conciliación bancaria y presentación de impuestos. La conexión con asesorías puede simplificar la gestión fiscal para quienes trabajan con profesionales externos.

La interfaz es funcional aunque no tan moderna como algunas alternativas. Las funcionalidades de gestión empresarial más allá de facturación y contabilidad son limitadas.

Puntos fuertes: Buena integración con asesorías, funcionalidades de contabilidad sólidas, conciliación bancaria.

Limitaciones: Interfaz menos moderna, funcionalidades de gestión empresarial limitadas, menos automatizaciones que competidores líderes.

Precio: Planes mensuales con diferentes niveles de funcionalidad.

6. Quipu

Mejor para: Autónomos que buscan gestión de gastos y facturación con digitalización de tickets.

Quipu se destaca por su funcionalidad de digitalización de tickets y gastos mediante el móvil. La aplicación permite fotografiar recibos y registrarlos automáticamente.

El programa ofrece facturación, control de gastos, conciliación bancaria y colaboración con gestorías. El enfoque en la digitalización de documentos resulta útil para autónomos con muchos gastos en efectivo.

Las funcionalidades de gestión empresarial integral son más limitadas que en plataformas todo en uno. Para negocios que necesitan inventario, CRM o gestión de proyectos, será necesario complementar con otras herramientas.

Puntos fuertes: Excelente digitalización de tickets, aplicación móvil funcional, colaboración con gestorías.

Limitaciones: Funcionalidades de gestión empresarial limitadas, menos opciones de personalización, puede requerir herramientas adicionales para necesidades complejas.

Precio: Planes mensuales con diferentes niveles de servicio.

Preparándote para los cambios normativos

Los Mejores Programas de Facturación en España: Guía Completa para Autónomos y Pymes
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La facturación en España está experimentando cambios significativos que afectan a todos los autónomos y empresas.

Verifactu: Lo Que Necesitas Saber

Verifactu es el sistema de emisión de facturas verificables impulsado por la Agencia Tributaria. Su objetivo es que las facturas emitidas sean confiables y difíciles de manipular para evitar el fraude fiscal.

A partir del 29 de julio de 2025, los programas de facturación deben cumplir con estos requisitos. Utilizar software no certificado generará problemas de cumplimiento que pueden traducirse en sanciones significativas.

La Factura Electrónica Obligatoria

Más allá de Verifactu, la factura electrónica obligatoria se acerca. Las facturas en PDF enviadas por correo electrónico quedarán obsoletas. La facturación electrónica estructurada será el nuevo estándar para todas las transacciones entre empresas.

Esta transición requiere actuar ahora. Intentar adaptarse en el último momento generará problemas que pueden evitarse eligiendo software preparado para estos cambios.

Cómo elegir el programa adecuado

Con tantas opciones disponibles, la elección depende de las necesidades específicas de tu negocio.

Si eres autónomo o tienes una pequeña empresa y buscas una solución integral que cubra facturación, contabilidad y gestión empresarial en una sola plataforma, las opciones todo en uno ofrecen el mejor valor. Automatizan más tareas y eliminan la necesidad de múltiples herramientas desconectadas.

Si solo necesitas facturación básica y tienes presupuesto muy limitado, las opciones gratuitas o de bajo coste pueden ser suficientes para comenzar. Ten en cuenta que probablemente necesitarás migrar a soluciones más completas conforme tu negocio crezca.

Si trabajas con asesoría externa, verifica que el software facilite la colaboración y el intercambio de información. Algunas plataformas están mejor preparadas que otras para este flujo de trabajo.

Independientemente de tu elección, asegúrate de que el software esté certificado para Verifactu. Los cambios normativos no son opcionales, y utilizar software no preparado generará problemas en el corto plazo.

Tu Negocio Merece Mejor Gestión

Las horas dedicadas a tareas administrativas manuales son horas robadas al crecimiento de tu negocio. Los errores de gestión manual son riesgos innecesarios. La falta de visibilidad financiera es una desventaja competitiva.

La tecnología existe para resolver estos problemas. Software de gestión en la nube que automatiza tareas, reduce errores y proporciona información clara sobre tu negocio está disponible y es accesible para empresas de cualquier tamaño.

Con las nuevas normativas de facturación entrando en vigor, el momento de modernizar la gestión es ahora. Aprovecha las pruebas gratuitas disponibles, evalúa las opciones y elige la plataforma que mejor se adapte a tus necesidades.

El tiempo que inviertes en gestión administrativa podría destinarse a hacer crecer tu negocio. Toma el control y automatiza lo que puede automatizarse.

 

Imagen cortesía de Redacción Opportimes | Opportimes